抗战胜利，复旦准备复员。国民政府对复旦反内战活动多有戒备，有意使复旦远离上海，迁往苏北贫瘠地区①。原江湾校园被敌伪占领后，另办伪上海大学。校舍破坏严重，男女宿舍、体育馆等已荡然无存，其余房屋多处损毁；又遭宵小趁火打劫。幸沪校师生立派土木、化学两系回江湾上课，就近加以照料。因校舍之故，复旦迁往何处，校内外颇有争议。

　　院系扩充计划

　　改国立后，复旦总体办学水平提高。1945年8月，学校制定复员后发展规划，对原有系科作大规模扩充：增设工学院，下设土木工程学系、机械工程学系、电机工程学系、化学工程学系、造船学系；文学院增设哲学系，原有史地学系分开，改设史学系；理学院数理学系分为数学系、物理学系，增设地理学系、地质学系；商学院增设国际贸易学系、工商管理学系、运输学系；农学院增设水产学系、蚕桑学系、农业化学系；法学院内各学系酌量分组，如外交组之类。复员后学生人数定为6000至10000人。12月，工学院筹备委员会成立。

　　接收敌伪房产

　　1945年秋，渝校照常开展教学。当时沪、渝两校合并，若全体学生迁往江湾上课，校舍根本不敷应用。10月，校长章益返沪，召集复员委员会(沪会)第一次会议，决定设法接收江湾附近之军营及其他房屋以作校舍之用，避免分江湾、无锡两地上课。复员委员会下设江湾校舍修理组、校舍扩充组、无锡临时校舍组、永久校舍设计组、充实设备组和财务组。

　　经上海敌产管理委员会奚玉书校友协助，

　　确定附属中学性质

　　复旦改国立后，在上海的复旦附属中学、实验中学继续保持私立性质。1945年11月3日，两校召开联合董事会议，决定其归属。原私立复旦大学附属中学定名为“上海市私立复旦中学”，校长李登辉，主任何恭彦，以海格路1626号为校舍。原私立复旦大学实验中学定名“上海市私立复旦实验中学”，校长李登辉，主任朱祖舜。两校各自成立校董会，主席均由李登辉担任。

　　顺利复员

　　经半年余修葺，江湾校舍恢复旧观。1946年5月8日，校务委员会(渝校)决定校舍使用计划：简公堂、子彬院、第四宿舍全部作为教室；第二宿舍为办公室；第一、三、四宿舍为女生宿舍；校外第三、四、五区为男生宿舍；第一、六、七区为教职员住宅；

　　6月，渝校最后一届毕业典礼在夏坝复旦礼堂举行。7月，首批师生400余人，分乘23辆汽车，沿川陕公路东行回上海。其余师生分四批乘民康、民联、民权、民本、民武、江和等轮船陆续东下。9月，渝校师生绝大多数回沪。复员过程中，总务长何恭彦不幸因公殉职。重庆北碚校址，由留川校友创办相辉文法学院，9月开始招生，院长许逢熙。

　　10月，沪、渝两校合并完成，开学上课。时有文、理、法、商、农五院20多个系及经济研究所等附属单位。1946年秋，投考学生达11000多人，录取400余人。此时，复旦拥有注册学生3692人，教员310人，其中专任268人，教授162人，副教授39人。(校史研究室 钱益民)