2000年“三讲”教育完成之后，作为落实“三讲”教育的整改措施，外交学院开始全面推行人事制度改革、分配制度改革和后勤管理社会化的改革。

　　2000年底，学院制订了关于机构调整和人事制度改革的方案。根据这一方案，学院将原有党政处级机构从14个精简为10个；教学、科研、教辅单位的系处级建制由10个精简为9个。处级党政领导职数从13正18副精简为12正14副；党政人员由原来的113人减少到87人，并开始实行岗位竞聘制度。同时，学院开始实行岗位津贴制度和课时费制度，推进分配制度的改革。

　　通过人事制度的改革，学院精简了机构和冗员，提高了办学效益；处级干部进一步年轻化、知识化、专业化，“竞聘上岗、能上能下”的观点深入人心，破除了职务“终身制”；从制度上打破了平均主义的“大锅饭”，较好地体现了以教学科研为中心、向教学科研人员倾斜、向一流人才倾斜的原则。

　　2002年5月，外交学院党委经外交部党委批准，作出扩大办学规模、开辟昌平新校园区的决定。

　　2003年7月，外交部任命吴建民同志担任外交学院院长，制定了外交学院改革发展的新思路。要点为：

　　一、认清形势，要有危机感。要看到学院当前面临的严峻挑战，看到学校在硬件建设、教师待遇等方面比其他高校落后很多。二、找准位置，坚定决心。要坚持突出外交特色的办学思路，发挥学院所长。三、深化改革，扩大开放。学院的出路在改革，要解放思想，转变观念，改变等、靠、要的局面。四、同心同德、开拓前进。

　　总之，随着我国高等教育改革的深入，外交学院的教育教学改革也掀开了崭新的一页。